Après une bataille intense, les forces du Seigneur Sith renégat ont été chassées d'Ilum. À présent, la République et l'Empire disposent tous deux des coordonnées de la station de combat du traître impérial. Sachant que leur victoire sur Ilum ne sera qu'un revers temporaire pour l'offensive de l'Empire renégat, la république décide qu'il faut frapper sans plus tarder.Elle fait appel ses héros les plus puissants pour monter à bord de la station de combat Sith volée et mettre un terme à sa marche sur la galaxie. Mais le Sith renégat s'y attend et sa station de combat est prête pour l'affrontement à venir. Les héros d'élite de la galaxie vont devoir affronter une armée quasiment infinie de droïdes et de soldats, avant d'affronter le Sith renégat et de neutraliser le nouvel Empire une bonne fois pour toutes.